6个省级临床重点专科:神经外科、普通外科、消化内科、心血管内科、重症医学科、儿科（妇儿院区）

3个省医学扶植重点学科:骨科、神经外科、胰腺外科

9个省区域专病中心建设学科:神经外科、普通外科、儿科、重症医学科、呼吸与危重症医学科、血液科、麻醉科、心胸外科、消化内科

2个省市共建学科:神经外科、普通外科

1个省中医名科:传统医学中心

1个省“十三五”中医药重点专科：脾胃病科

30个金华市医学重点学科：神经外科、肝胆胰外科、新生儿科、医学影像科、小儿外科、结直肠肛门外科、泌尿外科、检验科、超声医学科、儿科、烧伤整形科、眼科、麻醉科、心血管病学、妇科、呼吸与危重症医学、骨科、感染性疾病科、中医肿瘤学、耳鼻咽喉头颈外科、重症医学科、消化内科、急诊医学、神经病学、心胸外科、血液病学、风湿免疫科、肾脏内科、临床药学、肿瘤放射治疗学

3个金华市临床重点专科：心血管内科、重症医学科、感染性疾病科

1个金华市中医药重点专科：中医肺病科